Научные подразделения
- Отдел палеолита
- Лаборатория археологической технологии
- Отдел славяно-финской археологии
- Отдел археологии Центральной Азии и Кавказа
- Лаборатория камеральной и цифровой обработки, учета и хранения археологических коллекций
- Экспериментально-трасологическая лаборатория
- Отдел истории античной культуры
- Южносибирский филиал ИИМК РАН
- Научный архив
- Центр Спасательной Археологии